腋窝温度39℃属于中等程度的发热到高热的情况，这个体温相对比较高。人体正常的腋窝温度在36-37℃之间，如果出现感染的情况或其他疾病，引起体温调节中枢的异常，就会出现体温的异常升高。这种体温的升高是疾病的反应，体温升高的程度和疾病的严重程度呈一定的相关性。如果这种39℃的体温持续时间比较长，最好进行物理降温或化学的药物降温的方式进行退烧。最重要的是针对原发疾病进行治疗，只有原发疾病纠正了之后，体温的异常升高才能够真正的得到解决。