手指皮瓣手术的坏处有以下几种：
第一、手指的外观会变的臃肿，颜色由于缺氧可导致色素沉着。
第二、皮瓣本身的神经，如果皮瓣本身带有感觉神经，术后可能会接近正常，如果皮瓣没有感觉神经，在捏、握、抓、刺等日常生活中很容易产生糜烂、溃疡等情况。
第三、手指皮瓣手术之后，皮瓣区域的感觉功能比较弱，有麻木、感觉迟钝等情况，而且皮瓣区域的皮肤颜色比较深，和周围的皮肤颜色反差比较大。
综上所述，手指皮瓣手术是治疗各种原因引起的手指皮肤组织缺损的有效治疗方法，但是还是会有存在一些影响，所以手术之前一定要了解全面。