烧心和反流是胃食管反流病典型的临床表现，在药物治疗方面有以下几种药物：
一、促胃肠动力药，如多潘立酮、莫沙必利、伊托必利等。这类药物可能通过增加食管下段括约肌压力，改善食管蠕动功能，促进胃排空，从而达到减少胃内容物食管反流及减少其在食管的暴露时间。由于这类药物疗效有限且不确定，因此只适用于轻症患者，或作为抑酸药合用的辅助治疗。
二、抑酸药，有效降低损伤因素的作用，是目前治疗本病的主要措施。对初次接受治疗的患者或有食管炎的患者，应以质子泵抑制剂治疗，以求迅速控制症状，治愈食管炎。质子泵抑制剂抑酸作用强，适用于症状重、有严重食管炎的患者，一般按治疗消化性溃疡常规用量，疗程4-8周。对个别疗效不佳者，可加倍剂量或与促胃肠动力药联合使用，并适当延长疗程。
三、抗酸药，仅用于症状轻、间歇发作的患者，作为临时缓解症状用。