对于HPV病毒感染的女性，有可能需要使用α-干扰素栓来进行阴道局部塞药治疗，但也有可能需要做宫颈锥切手术治疗。还有一些HPV病毒感染的女性要做激光手术治疗，手术以后再用重组人干扰素α-2b凝胶进行局部涂抹治疗。
有极少部分女性在出现HPV病毒感染的时候可以不做任何的处理治疗，因为这类女性只是出现一过性的HPV病毒感染，并没有引起宫颈病变，也没有导致尖锐湿疣的发生，所以这时候不需要做特殊治疗，HPV就能够自然转阴。