小儿长期咳嗽、久治不愈要考虑以下特殊病因：
1、百日咳，百日咳表现为阵发性、痉挛性咳嗽，昼轻夜重，咳嗽后有鸡叫样的尾音。百日咳持续时间会比较长，需要到医院做相关的百日咳检测才能确诊。
2、考虑支原体感染，支原体感染也可引起较长时间的咳嗽，以干咳为主，需要到医院做支原体的相关检查才能确诊。
3、注意结核感染，结核除可以引起慢性咳嗽外，还伴随盗汗、消瘦、精神差，常有接触结核病人的病史，需要去医院做相关检查才能诊断。
4、咳嗽变异性哮喘，此时咳嗽不伴有发烧，用一般的消炎药没有效果，在情绪激动或者活动后咳嗽会加重，需要到医院检查并排除其他疾病才能诊断。