同房第二天小腹不舒服需要经过检查，具体情况具体分析。假如平时没有任何妇科疾病，也没有下腹部的不舒服，在同房后第二天出现了不舒服。有可能是在性生活的过程当中，男方的动作比较粗鲁，导致盆腔脏器的不适应，而出现小腹不舒服，这种不舒服多半2-3天就会逐渐消失。
另外的情况可能是平时就有潜在的盆腔炎，性生活以后可能刺激盆腔器官。这些炎症出现渗出、充血，也会出现小腹不舒服。临床出现了这种小腹不舒服，如果持续存在，需要到医院检查确诊，确定是炎症引起，需要对症用一些消炎药治疗。