牙床最后面肿痛，多半是由于智齿冠周炎导致的，如果是由于智齿冠周炎导致的，需要明确诊断，然后再对智齿周围的炎症进行冲洗。如果有脓液，将脓液引流同时还需要给予全身的抗生素应用，可以口服抗厌氧菌的抗生素，比如甲硝唑、奥硝唑或者是替硝唑，同时还要加服广谱抗生素，例如阿莫西林、头孢呋辛酯等。如果牙龈最后面肿痛不是智齿冠周炎导致的，而是第二磨牙出现的牙周脓肿，也是需要进行冠周冲洗，将脓液引流以后进行必要的牙周刮治，同时也需要全身的应用抗生素进行治疗。