杀死弓形虫目前公认有效的药物有乙胺嘧啶，磺胺嘧啶，螺旋霉素，克林霉素等。脑弓形虫病常用疗法为乙胺嘧啶，成人每日50mg，儿童1mg/kg，分2次服；加磺胺嘧啶成人每日4克，儿童150mg/kg，或者用复方磺胺甲恶唑成人2片，每日服2次，疗程最短3个月，超过4个月或更长时间则疗效更好。注意服药有可能发生白细胞，血小板减少，贫血，溶血以及神经系统症状等不良反应。对于孕妇先天性弓形虫病患儿，虽无症状也应该治疗。免疫功能低下的弓形虫隐性感染者，血清学实验从(-)转为(+)的孕妇的预防性治疗均可采用乙胺嘧啶，也可用螺旋霉素，成人每日2-4克，儿童50-100mg/kg，或克林霉素每日600-900mg，三周为一疗程，间隔一周再重复一疗程。