夜间上腹痛的主要原因是消化性溃疡，当有胃溃疡或者十二指肠球部溃疡的时候，会出现夜间的上腹疼痛。十二指肠球部溃疡的疼痛在进食以后会好转，而胃的溃疡在进食以后症状后加重。
还有部分病人夜间的上腹痛，要考虑胃部的肿瘤有关系，当出现肿瘤性病变的时候，常常会有上腹夜间疼痛的出现，多半还伴有消瘦、黑便、大便潜血等表现，通常在出现夜间上腹痛的时候。
这类患者需要做胃镜的检查来明确诊断。另外，还需要做个B超的检查排除胆道的病变。