药流有固定的服药方法，一般不能改动。
第一天服用米非司酮，米非司酮是孕激素拮抗剂，可以使胚胎松动，服用米非司酮要空腹，而且服药后两个小时尽量不要进食，进食会干扰米非司酮的吸收。第三天服用米索前列醇，米索前列醇是宫缩剂，可以诱发宫缩，将松动的孕囊排出体外，服用米索前列醇后半个小时左右会出现宫缩、出现腹痛，一般宫缩腹痛几个小时会看到孕囊排出，表现为白色、毛茸茸的组织物。
孕囊排出后两周复查B超，以除外宫腔蜕膜组织残留。如果有残留需要手术清宫，手术清宫率一般在10%左右，90%的药流都可以成功。