牙龈发黑的病因主要分内源性、外源性，内源性主要是来自机体内，天生就是牙龈黑色素和来自血红蛋白的各种色素比一般人增多造成，不属于病理性的，也无需治疗。
而外源性的主要来自于机体外，一般会表现在牙龈和牙体间的接壤处出现一条黑色的界限，主要是外源性的色素沉着，包括重金属铅、汞，经过血液循环被吸收了以后，在牙龈边缘形成了带状或线状的色素沉积。烤瓷牙，一些劣质的烤瓷牙由于铁离子的游离，也会造成牙龈处有一条黑色的黑线。