呼吸暂停综合征，主要是各种原因导致的，在睡眠状态下，反复出现呼吸暂停或低通气，引起低氧血症和高碳酸血症。治疗需要治疗原发病灶，如神经系统疾病、心力衰竭、呼吸系统疾病如慢阻肺等，可使用呼吸兴奋剂，比如常用药物可选择茶碱、阿米三嗪等，呼吸兴奋药物，可增加呼吸中枢的驱动力，改善呼吸暂停和低氧血症。
纠正低氧血症，还可选择进行氧疗，辅助通气治疗，主要是通过呼气末正压通气，选择有创和无创的机械通气。有肥胖者需要减肥，并且侧卧位休息，抬高床头，必要时需要针对于手术治疗，比如鼻中隔偏曲、鼻甲肥大、鼻息肉、舌下垂等，选择手术矫正呼吸道的狭窄状态，缓解症状。