手指及脚趾的关节疼痛一般有以下几种原因：
第一、风湿或者是类风湿。在风湿和类风湿疾病时，会出现四肢小关节的疼痛，同时可以伴有游走性疼痛，疼痛的同时可以伴有关节的畸形、肿胀；
第二、痛风。在痛风时也会出现脚趾和手指的多发关节的疼痛，同时可以出现尿酸盐的沉积，可以出现痛风石。这时可以在脚趾和手指的关节出现无菌性的包块，可以做CT检查确定是否是尿酸增高而引起的尿酸盐沉积出现的包块；
第三、骨性关节炎，在骨性关节炎时会出现脚趾和手指的关节的疼痛，同时可以出现关节处的结节。