在大阴唇的下方有一对腺体，起分泌黏液的作用，特别在性生活时可以产生巴氏腺的液体，使外阴起到润滑的作用。巴氏腺有其开口，其开口位于小阴唇的内侧，当外阴阴道的某些炎症造成腺管口阻塞时，常会形成巴氏腺囊肿。
巴氏腺囊肿是潴留囊肿，其内储留的是巴氏腺的液体，即清亮、黏稠的黏液，当巴氏腺囊肿合并有感染史，则会形成巴氏腺脓肿，而一般的囊肿患者除发现外阴有囊肿外没有明确的症状，有时经过穿刺或者造口手术仍然会反复发作，都与腺管口不通畅有关。