睡午觉起来头疼可能因为午觉的时间比较长，从而引起脑动脉暂时性缺氧而导致头疼，建议起床后多活动、多饮水，一般头疼可以慢慢的缓解。睡午觉起来头疼也可能是午觉之后出现急性上呼吸道感染，如果是感染引起的头疼，患者还会出现流鼻涕、鼻塞等症状，建议患者服用抗病毒的感冒药物，也可以服用对乙酰氨基酚等药物缓解头痛。
此外，睡午觉起来头疼也有可能是偏头痛发作。偏头痛的患者可以在很多情况下出现头痛的发作，比如劳累、着凉、感冒、熬夜、月经等均可诱发偏头痛。如果是偏头痛引起的头疼，建议患者给予相应的非甾体类镇痛药物缓解头痛，也可以给予针灸、理疗改善头痛。