胰岛素注射部位发生脂肪萎缩比较少见，主要是由于胰岛素结晶，可以引发机体对脂肪细胞产生局部的免疫反应。脂肪萎缩可以随着时间而消退，可能与未进行注射部位的轮换以及针头重复使用相关。
在新的指南中建议如果患者发生脂肪萎缩，应该改变胰岛素的剂型、改变注射部位或者是换为使用胰岛素泵治疗，有报道认为脂肪萎缩可以发生在所有的注射部位。另外，在患有其它自身免疫疾病的年轻女性患者中，发生脂肪萎缩的风险可能会更高。