尿发红最常见的原因是血尿，也就是说尿中出现了红细胞，根据红细胞多少分为镜下血尿或肉眼血尿，顾名思义镜下血尿就是只有用显微镜才能看得到的血尿，而肉眼血尿就是凭肉眼就能够分辨出尿中有血液。出现血尿要看伴随的症状，如果全程无痛肉眼血尿，就高度警惕是泌尿系肿瘤的可能性，要详细进行检查。当然有一些老年男性前列腺增生，偶然也会出现全程无痛肉眼血尿，如果血尿伴有尿频、尿急、尿痛，很可能是尿路感染的症状，比如普通的细菌感染以及支原体、衣原体感染，性病或者是泌尿系结核都可能会出现血尿以及伴随尿频、尿急、尿痛等刺激症状。如果血尿的同时伴有剧烈的腰痛，临床上最常见的原因是结石，结石引起输尿管痉挛、肾积水的时候会出现剧烈的疼痛，也称为肾绞痛。这时往往会伴有血尿。其他的原因，例如创伤、尿路留置导管等等也可以出现血尿的症状。
尿发红还有可能是血红蛋白尿，也就是尿中没有完整的红细胞，而能够检测到血红蛋白的成分，常常出现在溶血的患者。有时大面积创伤也可以出现这种情况，还有一些食物也可以引起尿发红，例如大黄类的药物利福平、酚酞、环磷酰胺，食物当中的甜菜、红心火龙果含有色素，也可以使尿液发红。以上这些情况个人如果无法简单的区分，最好还是到医院进行化验和检查，以免贻误病情。