扁桃体化脓和咽峡炎有区别，扁桃体化脓是由于扁桃体上面有脓液，是由抵抗力下降、细菌及病毒感染引起急性的上呼吸道感染，扁桃体伴随有脓液，同时伴有高烧，38.5℃以上。
咽峡炎主要是咽腔黏膜的充血、淋巴滤泡增生，一般在慢性期不会伴有发烧，只有在急性期才会有发烧，所以咽峡炎和扁桃体化脓是不一样的。扁桃体化脓，扁桃体上面有脓液，咽峡炎没有脓液，同时扁桃体化脓一般伴有高烧，在38.5℃以上。
两者治疗也不一样，扁桃体化脓需要全身应用抗生素，需要静脉点滴头孢类抗生素，同时还要口服抗病毒口服液联合治疗，一周以上可以控制症状；咽峡炎只需要局部的治疗就可以控制症状。