巧克力囊肿属于子宫内膜异位症的一种，会有痛经的表现。痛经严重或者是发生囊肿破裂，或者是扭转的，需要手术治疗，术后治疗需要预防复发。现在常用的方法有：1.中药综合调理，通过把脉，辩证治疗，中药可以调理两周左右。2.外治法，通过直肠灌注疗法。3.可以通过针灸、理疗调理。平时自己要注意少吃辛辣油腻的食物、减少流产等宫内操作，生活中注意卫生。