新型冠状病毒核酸检测阳性时，说明感染了新型冠状病毒，是确诊新型冠状病毒的金标准。新型冠状病毒核酸检测阴性时，说明未感染新型冠状病毒。新型冠状病毒核酸检测是采取PCR扩增技术，在鼻咽拭子、痰和其他下呼吸道分泌物，以及血液、粪便、尿液等标本当中检测新型冠状病毒，检测下呼吸道标本更加准确，如痰和气道抽取物，核酸检测一般会受到病程、标本采集、检测过程、检测试剂等因素的影响，为了提高检测阳性率，应该规范采集标本，标本采集之后要尽快送检。对于高度可疑的病人，如果新型冠状病毒核酸检测是阴性，需要复检，两次复检的时间应该大于24小时。
新型冠状病毒特异性抗体，IgM抗体和IgG抗体阳性可以辅助诊断。新型冠状病毒特异性抗体IgG抗体由阴性转为阳性，或者是恢复期时IgG抗体滴度较急性期呈四倍以上升高，也有助于诊断。