大脚趾第二关节疼痛可以是以下几种原因引起：
第一、痛风，痛风最常累及的关节就是大拇趾的关节，这时可以有关节的疼痛，同时伴有肿胀、皮肤红肿，严重者会有痛风石形成，这时要化验血尿酸，拍摄脚的X线片来诊断和治疗。
第二、感染性的疾病，当大脚趾的关节有细菌或者是结核菌感染时，可以有关节的疼痛，可以伴有关节肿胀以及皮肤红肿，这时要化验血、检查病原学以及拍摄脚趾的X线片、核磁共振来诊断和治疗。
第三、风湿和类风湿，这两种疾病也可以导致大脚趾关节的疼痛，可以伴有肿胀和畸形，这时要化验血以及拍摄脚的X线片来早期的诊断和治疗。