肛门退热栓使用时应排空大便，注意局部卫生，避免伤及肛门部位皮肤。肛门退热是属于外用的方法，可通过肛门退热栓直接通过肛门给药，可起到退热作用。
在使用退热栓之前，需要患者排空大便，使用清水或淡盐水清洗肛门，保持局部清洁卫生，操作者可带上手套，可防止指甲过长划伤患者肛门皮肤，肛门部位保持放松，或在保持排便的用力方向，轻轻把栓剂塞入患者肛门之内，塞入肛门口1-4cm左右即可。
在给患者塞入退热栓之后，应让患者卧床或者是俯卧位休息，应减少活动可避免药物脱落出肛门以外，在使用退热栓30分钟之后开始退热，1小时之后没有效果应更换退热方法。