脱髓鞘病变和脑囊虫本身在病因就是不同的。但是如果症状比较轻在临床症状上也可能会有相同的症状，都有可能会出现头疼头晕的症状。所以不是很好鉴别，但是两者症状还是有一定的区别，如果症状不典型，可以通过脑部CT或者磁共振检查可以帮助鉴别。同时可以通过病史，脑脊液检查，囊虫补体结合试验，以及临床症状等予以鉴别。