甲功六项检查一般是查甲状腺疾病，包括总T3、总T4、游离T3、游离T4，这是甲状腺的激素。
同时，还要检查调节甲状腺激素合成、分泌的促甲状腺激素TSH，这是由垂体分泌。甲状腺激素水平升高，促甲状腺激素水平就下降，甲状腺激素水平下降，促甲状腺激素水平升高，它们之间形成负反馈调节机制。
第六项有些地方是可以查甲状腺球蛋白抗体、微粒体抗体、促甲状腺激素受体抗体，主要的检查是甲亢、甲减、桥本氏甲状腺炎，主要是看甲状腺激素水平分泌的程度来确定患者是发生甲亢、甲减、桥本氏甲状腺炎等。