男性出现小肚子痛，具体需要挂哪一个科室，要根据患者症状的类型及疾病的可能性来进行判断。具体如下：
1、如果是泌尿系统相关疾病，如膀胱炎症、前列腺炎症、急性或者慢性的尿潴留、泌尿系统的结石等等，需要挂泌尿外科来进行诊治。
2、如果是胃肠道相关疾病，如肠套叠、肠梗阻、肠肿瘤、阑尾炎等等，需要挂胃肠外科进行就诊。
出现小肚子疼痛，需要进行解痉、止痛，对症治疗，然后进行血常规、尿常规、彩超、CT等相应的检查，明确病因，然后针对病因进行治疗。