菟丝子丸的功效与作用是可以补肾阳、壮腰膝、固下元，古今有好多菟丝子丸的方剂，其组方不同，其中《太平惠民和剂局方》里面提到菟丝子丸可以治疗肾气虚损、元阳不足所出现的症状，如患者出现的腰膝酸软、无力、阳痿、遗精、小便频数，以及腰部冷、腰酸、周身乏力等。
临床上菟丝子丸对于男性的阳痿、早泄等，都有辅助的治疗价值。另外，通过该药可以很好的提振肾阳，其作用和金匮肾气丸有类似之处。肾阳不足的情况由多种原因所造成，包括长时间体力透支，以及男性性生活不节制等，都会造成男性肾阳虚的情况，通过菟丝子丸来进行补养。治疗期间不要吸烟、饮酒、熬夜，也不要有性生活，这些对于辅助治疗疾病都有益处。