男性阴茎上长水疱，可能的原因：1、疱疹病毒感染，可以出现包皮、龟头等部位簇状分布的水疱，水疱体积较小，伴有局部的红肿，伴有疼痛。疱液破裂以后可以形成糜烂面，并且可以出现渗出，引起剧烈的疼痛等，大多是通过不洁的性接触传播。如果有过不洁的性接触后出现阴茎上长水疱，多考虑此病。需要进行疱疹病毒的检测，并给予抗病毒治疗。2、包皮龟头炎，可以出现阴茎上的水疱。随炎症进一步发展，可以转变为脓疱，伴有龟头或者包皮红肿，伴有红斑、糜烂等改变。需要进行相关的病原学检测来进行确诊，确诊以后抗感染治疗。真菌和滴虫感染引起，也可以出现水疱，伴有分泌物增多，多有过不洁的性接触史。伴有龟头瘙痒，伴有局部红肿的改变，需要进行真菌和滴虫的相关检测来确诊。