如果来月经的时候右侧小腹非常痛，可能的原因有盆腔炎症、子宫收缩引起的疼痛，以及其它妊娠相关因素等。如果有盆腔炎症，局部会增厚或者出现包裹性渗出液，来月经的时候盆腔会充血，再加上子宫收缩对附件区有一定的牵拉和刺激作用，可以导致疼痛。
子宫收缩引起的疼痛是比较常见的经期腹痛，由于子宫在盆腔中的位置可以活动，如果小腹右侧非常疼痛，可能这个时候子宫位置偏右，所以表现为小腹右侧的疼痛，随着经血的排出疼痛会减轻。
还可能和异常妊娠有关，如果已经怀孕了，但是孕激素水平偏低，不足以维持正常妊娠，会有阴道出血伴随腹痛，可能会被误认为来月经。出现宫外孕的时候有的人也会来月经，容易误以为是经期腹痛。