乙肝合并肝功能异常的治疗方法大体上分为：保肝治疗和抗病毒治疗。肝功能异常的保肝方法有口服保肝药物疗法和静脉滴注保肝药物疗法。肝功能轻度发生异常时，可以应用口服的保肝药物，肝功能中度或者重度异常时，需要静脉滴注保肝药物。抗病毒疗法有口服抗病毒治疗方法和注射抗病毒药物治疗方法。目前我国有六种口服抗乙肝病毒的药物，只需要选择一种，每日一粒口服即可。注射疗法主要是干扰素类药物，分为普通干扰素和聚乙二醇干扰素。普通干扰素需要每日或者隔日注射一次，聚乙二醇干扰素属于长效干扰素，只需要每周注射一次即可。