酒精和双氧水两者相比，双氧水消毒的效果更好。双氧水能够杀灭细菌、真菌，包括破伤风杆菌、厌氧菌等。但是，双氧水在使用的过程中会导致伤口内部出现剧烈疼痛，多用在伤口有感染或者创伤的伤口，需要清创缝合的伤口消毒的时候使用。在使用双氧水之后还需要用生理盐水反复冲洗，将双氧水消毒以后的创面冲洗干净。
酒精的主要成分是乙醇，主要是用在完整皮肤表面的消毒，比如手术之前碘酊消毒之后用酒精进行脱碘，碘伏消毒伤口之后在切皮之前，也需要用酒精再消毒一遍，或者在抽血之前在穿刺的地方用酒精进行消毒。伤口表面或者伤口内部不用酒精消毒，因为酒精具有刺激性，消毒之后会导致伤口明显疼痛。