膝关节外侧有个软包突起，并伴有疼痛的临床症状，可以考虑做以下几项检查：
一、体格检查：是由骨科门诊医生使用双手，根据临床经验进行的检查，通过双手触摸以及活动膝关节，可以初步确认膝关节外侧的软包突起是何种病变，一般可考虑为半月板囊肿、半月板损伤。
二、影像学检查：一般膝关节出现软性包块，并且伴有疼痛的临床症状，需要采用膝关节核磁共振进行检查，半月板等组织属于软性组织，通过核磁共振检查可以清晰判断半月板是否发生了囊肿或者出现了损伤。
通过以上两种方法的综合判断，可以最终确诊膝关节外侧软包突起并伴有疼痛的病因。如果是半月板囊肿，需要考虑关节镜手术进行治疗。如果是半月板损伤，需要根据半月板损伤程度决定治疗方法，如果为Ⅰ度或者Ⅱ度，一般采用保守治疗，如果是Ⅲ度损伤，通常需要采用手术缝合治疗。