脑神经的损伤常见于各种外伤、脑出血或缺血性疾病，常因损伤部位属于不同功能区而伴随各种各样的临床表现。
早期发生脑损伤关键在于解除病因，避免继发性损伤，如外伤出血引起的颅脑损伤应及早手术解除血肿或骨折的压迫，中期应预防及治疗水肿引发的继发性损伤，为保证功能区域的功能，必要时应行去骨瓣减压术或内减压术。后期患者出现神经功能缺陷的，可以针对意识或肢体功能的缺损进行相应的康复治疗，如反复经颅磁刺激、针灸等。一些药物如胞磷胆碱钠、乙酰谷酰胺、神经节苷脂、鼠神经生长因子等，都属于神经营养药物，对于恢复神经功能均有一定的效果。
颅神经的修复在临床上属于比较难的一种情况，应结合实际进行综合治疗。