抗真菌的药物种类很多有数十种，可以根据作用分成浅部真菌的药物还有深部真菌的药物。根据的作用机制可以分为作用于真菌细胞膜上的药物，作用于真菌细胞壁上的药物，还有抑制真菌核酸合成的药物。
按照结构分类分成了三唑类的抗真菌药物，像咪康唑、氟康唑、伏立康唑等等，多烯类的抗真菌药二性霉素B，烯丙胺类的抗真菌药物盐酸特比萘芬、尼可霉素、氟胞嘧啶、灰黄霉素等等。
抗真菌的药物种类非常多，包括我们中药里边的土槿皮酊、大蒜制剂都有抑制或杀灭真菌的作用。