医院男科的检查项目有很多，主要根据每个人的病情，选择不同的检查方法。常见的男科检查方法有体格检查、影像学检查、传染病检查和激素检查等。体格检查由临床医师来完成，主要检查男性生殖系统器官，比如睾丸、附睾、阴茎的发育情况，有无畸形、精索静脉曲张、包皮过长、包茎等。
影像学检查常见的检查项目，比如前列腺的超声，睾丸、附睾、精囊、精索静脉的超声等。精液检查是通过手淫的方法取精液，然后到检验科进行化验。精液检查可以初步评估男性的生育能力，包括精液的量、液化时间、酸碱度、黏稠度，还有精子的密度、精子总数、精子的活力和精子的形态学检查等。