晨起有眼屎也要看眼屎的性质以及多少，如果是偶尔一点的眼屎，可能跟近期的休息不好或者卫生不佳所导致。但是可能并没有引起严重的感染性结膜炎，经过休息或者减少用眼，往往就能够逐渐的缓解。
如果是早起时，黄色脓样的眼屎比较多，特别可能糊在眼皮上阻碍睁眼睛，就要考虑细菌感染性结膜炎，是由于细菌感染所导致，多是由于用眼卫生的不当所引起，可以使用抗菌类的药物，比如左氧氟沙星或者妥布霉素滴眼液。
如果是白色的眼屎比较多，并且眼白充血很严重，特别的是会有流泪异物感的现象，可能是由于病毒感染所引起来的病毒性结膜炎。
通常是由于休息不好或者熬夜、喝酒引起机体抵抗力下降，所引起来的病毒感染，需要使用抗病毒的药物，比如更昔洛韦眼用凝胶或者阿昔洛韦滴眼液等。