霉菌性阴道炎是由于感染的霉菌所导致的，正常女性阴道内也可以有霉菌的存在，但是当女性的抵抗力下降的时候，阴道里面原本会存在很多有益的细菌，比如说乳酸杆菌等这一类阴道卫士就会减少，继而就会发生一些霉菌或者其他杂菌的增生。当女性在妊娠期糖尿病或者糖尿病以及其他的一些妊娠期状态下，都是容易感染霉菌性阴道炎的，由于体内的一些炎症而需要较长时间应用抗生素的时候，也容易导致引导阴道内的菌群失调，从而引起霉菌性阴道炎的发作。
除此之外，还有一些女性由于应用了一些不干洁的卫生用品或者是泡了温泉以及用了一些不是特别卫生的马桶、坐垫等，极个别的情况下也有可能会感染。如果男性感染了，绝大多数的男性并不会有额外的不适症状，但是也会通过性生活传播给女性，导致女性霉菌性阴道炎的发生。