甲氨蝶呤一定要在医生的指导下使用，具体用药时间、停药时间需要医生根据患者的病情决定。
甲氨蝶呤片是处方药，用于急性白血病、癌症，如淋巴瘤，还用于多发性的骨髓病治疗等，此药有超说明书的用药，如可以治疗类风湿性关节炎、系统性红斑狼疮，此时用药的剂量有常规地调整。用于类风湿关节炎一般都是每周给药1次，剂量按每个人不同的情况来给予。用于其它的治疗大概每周1-2次。由于是处方药，所治疗的疾病特殊性，停药还有使用、剂量的调整等都应在医生指导下，医生的处方或医嘱的指导下，在医院经过规范地诊疗以后，由医生来决定，而不是由患者自行决定是否停药。什么时候患者可以自行停药，在院外自己吃药的时候出现严重的不能忍受的不良反应或出现症状加重或新症状时，可暂时停药，同时一定要及时到医院就诊。
日常生活中建议患者用药前强仔细查看药品说明书，了解用药的注意事项、用法、用量以及药物的相互作用等信息。用药一段时间根据医生的要求定期复查、复诊。