三个月宝宝流口水可能是由于以下的原因：
1、正常的生理现象，宝宝在3-4个月的时候唾液分泌增加，尤其是5-6个月分泌更明显，但是由于小婴儿口腔容量小，吞咽功能可能也比较差，不能及时吞咽所分泌的唾液，会发生生理性的流涎，随年龄增长这种情况会逐渐好转，所以三个月宝宝流口水可能是正常的生理现象；
2、口腔疾患，三个月的宝宝容易出现口腔疾患，如鹅口疮等，可能会影响宝宝吞咽，出现流口水的情况，这个时候要检查口腔，看看口腔内是否有白色膜状附着物，如果有鹅口疮要及时的给予治疗，缓解宝宝流口水的情况。
此外，宝宝流口水要注意护理，防止口周出现口水疹，可以用温水清洗口周，然后涂上润肤霜，隔离口水对皮肤的刺激。