女性小便时小肚子有点疼痛，建议到医院进行检查，可能的原因如下：
1、膀胱炎，发生有炎症时，膀胱黏膜充血、水肿伴有炎性糜烂反应，这样在排尿时或者憋尿时，都可以出现有小腹部疼痛，可伴有尿频、尿急，严重的患者可能会伴有排尿出血的现象，需要到医院进行尿液化验检查，进一步的确诊。
2、膀胱结石，在结石随尿液流动的过程中，可以造成有局部刺激感而产生有小腹部疼痛，部分患者可伴有排尿中断现象，尿频、尿急等症状。少部分患者可能会出现有血尿，需要进一步的进行泌尿系统的B超检查来确诊。
3、泌尿道的肿瘤，往往见于高龄患者，如果出现有肿瘤早期，可能会出现血尿的症状，后期可能会出现排尿时小腹部疼痛，需要进一步的进行泌尿系统的B超、CT、或者膀胱镜检查，进一步排除。