PET-CT检查的副作用很少，因为它是算是一种相对安全的检查方式，唯一的副作用就是对人体有一定的辐射。检查的过程中机器会对人体产生一定的辐射，再就是在检查的过程中所使用的放射性核素会对人体产生一定的辐射。
由于在检查的时候使用的核素剂量非常低，所以对人体的辐射也比较低，而且在检查完之后，核素大概十个小时左右就能够从体内代谢出去，所以对人体的影响也不是很大，患者在检查完之后，只要在一天之内尽量不接触孕妇和儿童就可以。