盐酸伐昔洛韦片上市后的不良反应报告显示，偶见患者出现头晕、头痛、关节痛、恶心、呕吐、腹泻、胃部不适、食欲减退、口渴、白细胞下降、尿蛋白及尿素氮轻度升高、皮肤瘙痒等不良反应，长期使用偶见患者会出现痤疮、失眠、月经紊乱等不良反应。
对于脱水或已有肝、肾功能不全患者慎用，肾功能不全者在接受此药进行治疗时，需要根据肌酐清除率来校正用药剂量。用药期间应充分喝水以防止伐昔洛韦在肾小管内沉淀，对肾功能造成伤害。盐酸伐昔洛韦属于抗病毒药物，食物会对药物吸收有影响，故需要空腹服药。此药属于处方药，必须在医生的指导下合理使用。