肛瘘手术分为三种形式：
1、平时讲的有外口、窦道和内口的肛瘘。这个一般选择以探针从外口经窦道顺利进入到内口，提起两端的探针，探查肛瘘是低位还是高位。如果是低位肛瘘，直接电刀切开，将瘘管完全敞开，则肛瘘就可以完全愈合。
2、因为高位肛瘘直接切开有可能会损伤肛门括约肌，影响排便功能。这个时候可以选择行高位肛瘘的挂线术，术后恢复比较好。
3、还有一种肛瘘就是盲端瘘，没有明确的外口，有窦道和内口，多数是在肛门周围出现痛性的结节。手术将肛门口的肿块进行切除，寻找其根部，触及根部之后，然后剖开肿块以探针探查触及内口，再根据瘘管的高还是低，选择切开或者是挂线。