甲状腺功能减退治疗非常简单，使用左甲状腺素钠进行替代治疗。甲状腺功能减退由于各种原因，像手术破坏或者自身免疫性的炎症，或者甲亢碘-131治疗，造成甲状腺损伤，合成分泌甲状腺激素明显减少，会出现低代谢的症状，还有交感神经兴奋下降。
治疗在明确诊断以后，进行左甲状腺激素替代治疗，缺多少补多少。定期的进行甲状腺激素的测定，评估剂量是否合适，另外也可以评估安全性。患者千万要记住不能自行的停药，甲状腺功能减退绝大部分是由于甲状腺组织被严重的破坏，因此可能需要长期的服药。