灰指甲的表现在早期的时候可能不是很明显，可以出现指甲有小的凹点，有沟纹，或者有白色的斑点。之后随着真菌感染数量的增多，受累指甲越来越明显。
可以看到指甲变成黄色、棕色或者黑色，指甲会明显的增厚，而且从侧面上看，指甲是明显粗糙的，甲下的组织容易碎，容易形成指甲的碎甲，和指甲的小的、碎的颗粒，或者甲板非常凹凸不平，表面可以有粗糙的纹路。这个时候从化验室上，如果验甲真菌，可以发现真菌的阳性。
在少数情况下，如果指甲整个甲板或者是甲下受累及的时候，或者是说白色念珠菌感染引起甲真菌病的时候，经常会合并出现甲沟炎，也就是在指甲的周围出现红肿甚至有少量的脓液，这就是真菌甲癣所引起的甲周的损伤，这个时候患者往往会有疼痛等不舒服的症状。