非典的后遗症主要是由于长期大剂量使用激素所造成的，首先可以出现双侧的股骨头坏死，病人走路可以出现间歇性陂行，严重的可以出现疼痛，必须口服止疼药才能缓解症状。
其次肺部可以出现肺纤维化的症状，病人表现有乏力、气促、干咳等症状，甚至可以出现呼吸困难。然后有的病人可以出现生理或者心理的改变，可以出现记忆力下降、注意力不集中、工作能力降低，有的甚至无法长期进行工作。
最后由于亲人离故、家庭变故，许多人出现了抑郁、轻生等精神症状。