磁共振检查需要根据病人的病情及临床表现，到不同科室进行就诊，就诊医师会开具核磁共振检查单，然后付款预约进行检查。
如果是腹部磁共振检查可以挂肝胆内科、消化内科、神经内科以及泌尿中心。
如果是神经系统疾病如脑血栓、脑出血、脑部肿瘤等等，可以挂神经外科及神经内科。
如果是怀疑骨质病变或骨肿瘤等等，可以到骨科中心就诊。
如果是妇科和产科疾病，可以一并到产科中心和妇科中心就诊。
磁共振检查有许多必要的条件，如果病人体内有金属支架以及骨科的钢钉等等，都不可以进行磁共振检查，所以一定和就诊医生说清楚这些情况。