干扰素是一种细胞因子，是免疫细胞和某些非免疫细胞经过刺激以后合成分泌的一类具有广泛生物活性的小分子蛋白质。副作用主要是感冒样的综合征，比如用药剂量超过一定值大部分的患者都会出现发热、头疼、肌痛、关节痛等等。
还有血液系统的不良反应，有接近20%的患者会出现白细胞或者中性粒细胞、血小板中等程度的减少。神经系统还有一定的影响，10%-60%的患者会有轻度的不影响治疗的乏力、虚弱等等，其它的不良反应比如甲状腺功能的改变、肾功能改变等等。