夜间咳嗽厉害的疾病包括以下几个：
一、重症肺炎，重症肺炎出现夜间咳嗽加重，是由于迷走神经兴奋增高而导致的，需要进行积极的抗感染治疗，同时止咳治疗；
二、咳嗽变异性哮喘，咳嗽变异性哮喘的特点是夜间咳嗽加重，可完善肺功能等检查，确诊为咳嗽变异性哮喘后吸入支气管舒张剂、糖皮质激素，如信必可或舒利迭，口服白三烯调节剂，如孟鲁司特钠；
三、心功能不全可出现夜间咳嗽加重，要根据病情采取强心、利尿、扩血管等相关药物治疗，常用药物包括硝普钠、硝酸甘油、西地兰、呋塞米等。