阴茎有小白点最常见于阴茎皮肤内外板交界处分布着一些皮脂腺，皮脂腺不断分泌油性物质，与包皮脱落下来的污垢和尿液共同形成白色包皮垢，包皮垢散在分布在阴茎皮肤表面，形成阴茎小白点样改变，部分病人还会出现片状或小块状包皮垢散在分布在阴茎皮肤表面。
阴茎小白点还见于阴茎珍珠疹，病人发生阴茎珍珠疹时会在阴茎冠状沟表面形成白色小颗粒改变，表面光滑不伴有疼痛或瘙痒症状，常常与局部刺激或卫生条件差有关，多数病人会在50岁以后上述症状自行消退。