颈动脉内膜剥脱术从手术创伤和手术时间来看，并不是大手术，从手术的高危性来说属于大手术。
颈动脉内膜剥脱术在术中，大部分主刀医生可能会阻断10-15分钟，来进行完整的内膜剥脱以及缝合动脉内膜的切口，因此在阻断的过程中，可能会产生动脉栓塞而发生脑梗塞的症状。
另有一部分医生在进行内膜剥脱时使用转流管，避免颈动脉阻断的时间，在使用转流管的过程中也可以发生微血栓的形成，而导致患者手术后出现偏瘫、失语，有的可能会出现轻的神经症状。
颈动脉内膜剥脱虽然不是大手术，但是手术风险较大，有时还会诱发冠心病而致患者临床死亡。